De ChristenUnie Rijssen-Holten is formeel opgericht 29 september 2000, en dit is statutair vastgelegd op 23 december 2003. De ChristenUnie Rijssen-Holten komt voort uit de Reformatorisch Politiek Federatie Rijssen (RPF).
De RPF Rijssen werd in 1978 opgericht. De voorman was Jan Lingeman. Hij was later Proviciaal Statenlid in Overijssel voor de RPF. Tot 1986 was hij voorzitter. Daarna is Herman Leusink voorzitter geweest tot 1990. Vanaf 1990 tot 1 september 2006 is Wim Flim voorzitter van de RPF Rijssen, en later ChristenUnie Rijssen-Holten geweest. Sinds 9 november 2006 is Johan ten Hove voorzitter.